?????? Ngs ??? ??????????? ????????? ? ?????&#

Среди культивируемых ракообразных гигантская пресноводная креветка Macrobrachium rosenbergii до недавнего времени была одним из основных видов с высокой коммерческой ценностью. В последнее время он потерял популярность из-за болезней и дифференцированного роста самцов в силу социальной иерархии. Этот вид может вернуть свой прежний предпочтительный статус, если генетически улучшить его рост и устойчивость к болезням. Селекционная селекция значительно облегчается благодаря селекции с помощью маркеров (MAS). Однонуклеотидные полиморфизмы (SNPs) обеспечивают самое высокое разрешение, возможное для маркерной карты (изменение одного нуклеотида), являются ко-доминантными, би-аллельными и обычно многочисленными в популяциях с низким уровнем мутаций. Секвенирование ДНК с помощью платформ NGS считается наиболее экономически эффективным подходом. В данном исследовании поиск SNP проводился в транскрибированных последовательностях M. rosenbergii, доступных в GenBank, NCBI. Дикие экземпляры были собраны из различных водоемов. Были разработаны праймеры для амплификации кодирующих (CDS) и проведено секвенирование ампликонов на платформах GS-FLX 454 и Ion torrent. В разных популяциях было обнаружено 173 SNP. Такой подход для поиска SNP в представленных последовательностях был использован нами впервые.