Un programma per l'allineamento di sequenze multiple tramite STAR Alignment

L'allineamento delle sequenze utile per scoprire informazioni funzionali, strutturali ed evolutive nelle sequenze biologiche. importante ottenere il miglior allineamento possibile o il cosiddetto allineamento ottimale per scoprire queste informazioni. Inoltre, se due sequenze provenienti da organismi diversi sono simili, possibile che abbiano avuto un antenato comune e le sequenze vengono definite omologhe. Una volta trovato l'MSA, il numero di tipi di cambiamenti nei residui della sequenza allineata pu essere utilizzato per un'analisi filogenetica. In alcuni casi, la posizione cos importante per la funzione che i cambiamenti mutazionali non vengono osservati.