Sélection moléculaire et ressources génétiques du riz Tulaipanji

Ce livre traite des divers aspects de la variation des SNP/Indels dans les lign es de descendance (Tulaipanji x Ranjit) et les ressources g n tiques du riz sauvage Oryza rufipogon. Les germoplasmes de riz ont t d crits sur la base des propri t s morpho-physicochimiques, de l'analyse GCMS, du MEB des grains et des granules d'amidon. La technologie TILLING/Eco-TILLING bas e sur la g n tique inverse a t illustr e pour l'extraction d'all les. La m thode GBS bas e sur la NGS (Illumina) a t employ e dans cette tude pour analyser les variations SNP et InDel et leur sch ma d'introgression dans les lign es de descendance F5 (P-awn et P-awnless). Le nombre total de SNP identifi s tait de 52 810 et celui des indels de 4 327. Ces variantes n' taient pas r parties uniform ment sur les 12 chromosomes (d'apr s le Golden Helix G Browser). L' tude a montr que sur un nombre d'all les de 10013, 92,52% ont t introgress s dans P-awn partir de Tulaipanji et 7,485 partir de Ranjit, en revanche, P-awnless a port 89,19% partir de Ranjit et 10,81% partir de Tulaipanji. Cela est d une distorsion de la s gr gation. De nombreuses variations SNP sont associ es des caract res importants. Comme la GA20-oxydase (g ne sd1), l'Argonaute et la prot ine Dicer avec le domaine PAZ. Fichiers Fastq de quatre lign es de riz avec NCBI SRA Accession no. SRP077861, SRP077919, SRP077947 & SRP077977.