Optimierungsstrategien für das Docking flexibler Moleküle

Inhaltlich unver nderte Neuauflage. In den letzten Jahren ist strukturbasiertes virtuelles Screening zu einem wichtigen Schritt in der Erforschung neuer Wirkstoffe avanciert. Hier wird versucht, den Bindungsmodus zwischen einem Liganden, dem Wirkstoff, und einem Rezeptor, i.d.R. ein Protein, samt Bindungsaffinit t am Computer vorherzusagen. Der Autor Axel Griewel gibt einf hrend einen berblick ber verschiedene Ans tze zur L sung dieses Problems sowie eine Einf hrung in die algorithmischen Grundlagen des der Untersuchung zugrunde liegenden Programms FlexX. Anschlie end wird ein Branch&Bound Algorithmus samt Suchstrategie f r den inkrementellen Aufbau von Liganden in Rezeptortaschen vorgestellt. Die Evaluierung des Verfahrens erfolgt anhand von 169 Komplexen und zeigt eine hohe Genauigkeit bei der Platzierung der Liganden in der Tasche bei h herem Laufzeitbedarf. Des Weiteren wird eine Gegen berstellung zu den Ergebnissen der k-greedy Strategie vorgenommen. Dieses Buch richtet sich an Forschende in der Chemie- und Bioinformatik sowie an Anwender von Tools zum virtuellen Screening in der pharmazeutischen Industrie.