Melhoramento molecular e recursos genéticos do arroz Tulaipanji

Este livro trata dos v rios aspectos da varia o de SNPs/Indels nas linhas de descend ncia (Tulaipanji x Ranjit) e dos recursos gen ticos do arroz selvagem Oryza rufipogon. Os germoplasmas de arroz foram descritos com base em propriedades morfo-f sico-qu micas, an lise GCMS, SEM de gr os e gr nulos de amido. A tecnologia TILLING/Eco-TILLING baseada na gen tica inversa foi ilustrada para a extra o de alelos. O m todo GBS baseado em NGS (Illumina) foi utilizado neste estudo para analisar as varia es SNP e InDel e o seu padr o de introgress o nas linhas de descend ncia F5 (P-awn e P-awnless). O n mero total de SNPs identificados foi de 52.810 e de Indels 4327. Estas variantes n o estavam distribu das uniformemente pelos 12 cromossomas (com base no Golden Helix G Browser). O estudo demonstrou que, de um total de 10013 alelos, 92,52% foram introduzidos em P-awn a partir de Tulaipanji e 7,485 a partir de Ranjit; em contrapartida, P-awnless transportou 89,19% de Ranjit e 10,81% de Tulaipanji. Isto deve-se distor o da segrega o. Muitas varia es SNP est o associadas a caracter sticas importantes. Tais como GA20-oxidase (gene sd1), Argonaute e prote na Dicer com dom nio PAZ. Ficheiros Fastq de quatro linhas de arroz com NCBI SRA Accession no. SRP077861, SRP077919, SRP077947 & SRP077977.