Génomique comparative de Salmonella spp à l'aide de la PFGE

Salmonella spp. est l'un des principaux agents pathog nes alimentaires tudi s dans le monde. Salmonella provoque des maladies typho diques et non typho diques chez l'homme et l'animal. La parent g n tique des isolats a t corr l e l'aide du logiciel bioinformatique Applied Math. Une m thode standard d'isolement des salmonelles a t utilis e pour l'isolement des bact ries. Les colonies provenant des plaques microbiennes ont t confirm es l'aide des kits de d tection MicroSEQ Salmonella spp. et de la machine RT PCR Step One Plus d'Applied Biosystems. Un dendrogramme g n tique a t g n r l'aide du logiciel Applied Math partir des gels PFGE g n r s par la digestion Xbal des souches et en utilisant Salmonella braenderup (H9812) comme souche de r f rence. Cette technique a permis de corr ler les souches bact riennes provenant de volailles et d' chantillons environnementaux.