Obecnie, dzięki poprawie możliwości komputer w, modelowanie molekularne stalo się potężną techniką w chemii obliczeniowej o coraz większym znaczeniu praktycznym. Obecnie zastosowanie efektywnych algorytm w wraz z wydajnymi procesorami pozwala nam symulowac uklady zawierające tysiące atom w do kilku mikrosekund. Jednak znalezienie r wnowagi między kosztami obliczeniowymi a wiarygodnymi wynikami wciąż pozostaje wyzwaniem. Dwa og lne podejścia pomagają nam ujawnic zachowanie tych system w: mechanika kwantowa i obliczenia dynamiki molekularnej. Dynamika molekularna (MD) bada ruch zestawu oddzialujących ze sobą atom w, cząsteczek lub cząsteczek. MD może wyodrębnic obserwacje eksperymentalne z dynamiki systemu poprzez badanie ruchu systemu.