De vann kriget mot korruptionen. Men fienden lämnade en bomb kvar – i deras eget hem. Kommissarie Linnea Valborg och analytikern Leif Mattsson har överlevt den internationella jakten och det personliga sveket. Men segern har ett högt pris: Leif plågas av akut posttraumatiskt stressyndrom (PTSD) och en växande rädsla. När en ung student, nära Leifs barndomsvän, mördas, tvingas Linnea konfrontera sin största professionella skuld – Skuggan, en brutal mördare hon lät gå fri för tretton år sedan. Gängledaren Ivan Petrovic har iscensatt hämnden. När Maja dras in i skottlinjen, tvingas Leif till den ultimata uppgörelsen. För att bevara sitt äktenskap och sin hälsa tvingas Leif kliva av fältarbetet. Men han hittar en sista, kylig ledtråd: en detaljerad ritning av en Klocka – symbolen för den fängslade Klockmakaren. I Klockans Hemlighet avslutas en skuld, men en ny, farligare hemlighet tar sin början. Linnea har valt familjen, men Petrovic är inte klar. Jakten är över. Tills Klockan börjar ticka.